(от лат. trans — через и position — местоположение) — перемещение нуклеотидных последовательностей, так называемых мигрирующих элементов из одного сайта в другой. Известно два основных типа таких последовательностей — IS-частицы (insertion sequences) и транспозоны. IS-частицы не несут иной генетической информации, кроме той, которая необходима для их вырезания (эксцизии) и встраивания (инсерции). В составе их ДНК есть участок, кодирующий фермент транспозазу, который отвечает за их перемещение. Размер IS-частиц колеблется от нескольких десятков до нескольких тысяч пар нуклеотидов. Более сложные мигрирующие элементы — транспозоны, в отличие от IS-частиц, содержат в своем составе гены, не имеющие отношения к процессу транспозиции. Например, широко известны транспозоны кишечной палочки (Escherihia coli), в которых имеются гены устойчивости к антибиотикам. Встраивание мобильных генетических элементов в новый сайт генома (внутри какого-либо гена или рядом с ним) может вызвать мутацию или изменить генную экспрессию.